L'Atalanta illude nel preliminare di Europa League, poi si complica la vita. Nella gara d'andata i nerazzurri non sono andati oltre il 2-2 in casa (al Mapei Stadium) contro il Sarajevo, vanificando nella ripresa il doppio vantaggio firmato da Masiello e Mancini. Handzic e Sisic complicano il passaggio del turno.